Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nek3Q9R0A5 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms