Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Gpc6Q9R087 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gpc6Q9R087 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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