Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ercc4Q9QZD4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ercc4Q9QZD4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms