Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Snai3Q9QY31 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms