Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Csnk1eQ9JMK2 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms