Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Col5a3Q9JLI2 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Col5a3Q9JLI2 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms