Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
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Gde1Q9JL56 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gde1Q9JL56 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms