Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hmgn5Q9JL35 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hmgn5Q9JL35 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms