Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ybx3Q9JKB3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gstz1-203ENSMUST00000220574 971 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ybx3Q9JKB3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms