Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tuba8Q9JJZ2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Tuba8Q9JJZ2 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tuba8Q9JJZ2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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