Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Gfra4Q9JJT2 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gfra4Q9JJT2 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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