Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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