Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
OtofQ9ESF1 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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OtofQ9ESF1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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