Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ush1cQ9ES64 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms