Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Clstn2Q9ER65 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms