Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Clstn1Q9EPL2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms