Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Usp12Q9D9M2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp12Q9D9M2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms