Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Q9D727 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Q9D727 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Q9D727 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms