Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx29Q9D3S3 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms