Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Zbed3Q9D0L1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Zbed3Q9D0L1 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Zbed3Q9D0L1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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