Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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Sgo1Q9CXH7 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Sgo1Q9CXH7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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