Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Utp23Q9CX11 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms