Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atxn3Q9CVD2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms