Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ifitm3Q9CQW9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ifitm3Q9CQW9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
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Ifitm3Q9CQW9 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ifitm3Q9CQW9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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