Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
PsenenQ9CQR7 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms