Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Atg3Q9CPX6 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms