Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bhlhe41Q99PV5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bhlhe41Q99PV5 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bhlhe41Q99PV5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Bhlhe41Q99PV5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Bhlhe41Q99PV5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms