Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Prpf8Q99PV0 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms