Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim26Q99PN3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim26Q99PN3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms