Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Nus1Q99LJ8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nus1Q99LJ8 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms