Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Prpf19Q99KP6 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms