Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab28Q99KL7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Rab28Q99KL7 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rab28Q99KL7 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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