Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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TrabdQ99JY4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TrabdQ99JY4 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TrabdQ99JY4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TrabdQ99JY4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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TrabdQ99JY4 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
TrabdQ99JY4 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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