Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apobec3Q99J72 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apobec3Q99J72 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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