Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm16537-201ENSMUST00000161529 702 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tnnt1-206ENSMUST00000163710 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 BC025446-202ENSMUST00000185307 758 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Csmd1Q923L3 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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