Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klc3Q91W40 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms