Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Dkk4Q8VEJ3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms