Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
MyripQ8K3I4 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
MyripQ8K3I4 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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