Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Brd3Q8K2F0 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms