Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rasgef1bQ8JZL7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rasgef1bQ8JZL7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Rasgef1bQ8JZL7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Rasgef1bQ8JZL7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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