Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Upp2Q8CGR7 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Upp2Q8CGR7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 495.8 ms