Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
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