Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx8Q8CFD4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Snx8Q8CFD4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Snx8Q8CFD4 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Snx8Q8CFD4 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Snx8Q8CFD4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Snx8Q8CFD4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Snx8Q8CFD4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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