Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms