Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ccdc38Q8CDN8 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms