Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Lrif1Q8CDD9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Lrif1Q8CDD9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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