Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Amigo3Q8C2S7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Kcne3-202ENSMUST00000170954 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Amigo3Q8C2S7 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Amigo3Q8C2S7 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Amigo3Q8C2S7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Amigo3Q8C2S7 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Amigo3Q8C2S7 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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