Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttc21aQ8C0S4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttc21aQ8C0S4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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