Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ccser1Q8C0C4 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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