Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Rnf187Q8BFX1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf187Q8BFX1 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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